Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3a1Q9QX15 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms