Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms