Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms