Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RhoaQ9QUI0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms