Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trappc2lQ9JME7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Trappc2lQ9JME7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trappc2lQ9JME7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trappc2lQ9JME7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trappc2lQ9JME7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trappc2lQ9JME7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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