Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms