Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prg3Q9JL95 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prg3Q9JL95 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prg3Q9JL95 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prg3Q9JL95 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prg3Q9JL95 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prg3Q9JL95 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prg3Q9JL95 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prg3Q9JL95 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prg3Q9JL95 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prg3Q9JL95 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prg3Q9JL95 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prg3Q9JL95 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prg3Q9JL95 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prg3Q9JL95 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prg3Q9JL95 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prg3Q9JL95 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prg3Q9JL95 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prg3Q9JL95 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prg3Q9JL95 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prg3Q9JL95 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prg3Q9JL95 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms