Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
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Gde1Q9JL56 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
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Gde1Q9JL56 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Gde1Q9JL56 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
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Gde1Q9JL56 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Gde1Q9JL56 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Gde1Q9JL56 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Gde1Q9JL56 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Gde1Q9JL56 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Gde1Q9JL56 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Gde1Q9JL56 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Gde1Q9JL56 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Gde1Q9JL56 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Gde1Q9JL56 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms