Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Chrac1Q9JKP8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms