Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms