Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms