Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms