Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2j1Q9JJZ4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms