Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT0

Rcl1, RNA 3'-terminal phosphate cyclase-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcl1Q9JJT0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rcl1Q9JJT0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rcl1Q9JJT0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rcl1Q9JJT0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rcl1Q9JJT0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rcl1Q9JJT0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rcl1Q9JJT0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rcl1Q9JJT0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rcl1Q9JJT0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rcl1Q9JJT0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rcl1Q9JJT0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rcl1Q9JJT0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rcl1Q9JJT0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rcl1Q9JJT0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcl1Q9JJT0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms