Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Efcc1Q9JJF6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms