Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms