Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ercc6l2Q9JIM3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms