Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms