Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Brd4Q9ESU6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms