Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Rb1cc1Q9ESK9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Rb1cc1Q9ESK9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms