Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms