Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERV1

Mkrn2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn2Q9ERV1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mkrn2Q9ERV1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mkrn2Q9ERV1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mkrn2Q9ERV1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mkrn2Q9ERV1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mkrn2Q9ERV1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mkrn2Q9ERV1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mkrn2Q9ERV1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mkrn2Q9ERV1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mkrn2Q9ERV1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mkrn2Q9ERV1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mkrn2Q9ERV1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mkrn2Q9ERV1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Mkrn2Q9ERV1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mkrn2Q9ERV1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mkrn2Q9ERV1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mkrn2Q9ERV1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mkrn2Q9ERV1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mkrn2Q9ERV1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mkrn2Q9ERV1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mkrn2Q9ERV1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mkrn2Q9ERV1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mkrn2Q9ERV1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mkrn2Q9ERV1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mkrn2Q9ERV1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mkrn2Q9ERV1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mkrn2Q9ERV1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mkrn2Q9ERV1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mkrn2Q9ERV1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms