Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms