Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms