Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SgshQ9EQ08 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms