Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufa8Q9DCJ5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms