Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Xab2Q9DCD2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms