Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBF7

Cwc25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc25Q9DBF7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cwc25Q9DBF7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cwc25Q9DBF7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cwc25Q9DBF7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cwc25Q9DBF7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cwc25Q9DBF7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cwc25Q9DBF7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cwc25Q9DBF7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cwc25Q9DBF7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cwc25Q9DBF7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cwc25Q9DBF7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cwc25Q9DBF7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cwc25Q9DBF7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cwc25Q9DBF7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cwc25Q9DBF7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cwc25Q9DBF7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cwc25Q9DBF7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc25Q9DBF7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc25Q9DBF7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc25Q9DBF7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc25Q9DBF7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc25Q9DBF7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc25Q9DBF7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc25Q9DBF7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc25Q9DBF7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc25Q9DBF7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc25Q9DBF7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc25Q9DBF7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc25Q9DBF7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc25Q9DBF7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms