Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smg9Q9DB90 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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