Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms