Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn3Q9DAW9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn3Q9DAW9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn3Q9DAW9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn3Q9DAW9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn3Q9DAW9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn3Q9DAW9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn3Q9DAW9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn3Q9DAW9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn3Q9DAW9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn3Q9DAW9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn3Q9DAW9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn3Q9DAW9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn3Q9DAW9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn3Q9DAW9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn3Q9DAW9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn3Q9DAW9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms