Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Asf1bQ9DAP7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Asf1bQ9DAP7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms