Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9DA42 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9DA42 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9DA42 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9DA42 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9DA42 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9DA42 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9DA42 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9DA42 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9DA42 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9DA42 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9DA42 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9DA42 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9DA42 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9DA42 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9DA42 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9DA42 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9DA42 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9DA42 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9DA42 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9DA42 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9DA42 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9DA42 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9DA42 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9DA42 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9DA42 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9DA42 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9DA42 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9DA42 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9DA42 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9DA42 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9DA42 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9DA42 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9DA42 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9DA42 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9DA42 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9DA42 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9DA42 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9DA42 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9DA42 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9DA42 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9DA42 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9DA42 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9DA42 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9DA42 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9DA42 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9DA42 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9DA42 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9DA42 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9DA42 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9DA42 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9DA42 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9DA42 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9DA42 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9DA42 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9DA42 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9DA42 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9DA42 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9DA42 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9DA42 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9DA42 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9DA42 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9DA42 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9DA42 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9DA42 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9DA42 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9DA42 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9DA42 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9DA42 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9DA42 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9DA42 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9DA42 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9DA42 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9DA42 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9DA42 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9DA42 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9DA42 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9DA42 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9DA42 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9DA42 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9DA42 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9DA42 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9DA42 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9DA42 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9DA42 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9DA42 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9DA42 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9DA42 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9DA42 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9DA42 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9DA42 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9DA42 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9DA42 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9DA42 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9DA42 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9DA42 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9DA42 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9DA42 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9DA42 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9DA42 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms