Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smco2Q9DA21 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smco2Q9DA21 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smco2Q9DA21 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smco2Q9DA21 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smco2Q9DA21 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smco2Q9DA21 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smco2Q9DA21 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smco2Q9DA21 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smco2Q9DA21 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smco2Q9DA21 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smco2Q9DA21 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smco2Q9DA21 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smco2Q9DA21 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Smco2Q9DA21 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smco2Q9DA21 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smco2Q9DA21 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smco2Q9DA21 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smco2Q9DA21 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smco2Q9DA21 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smco2Q9DA21 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smco2Q9DA21 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smco2Q9DA21 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smco2Q9DA21 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smco2Q9DA21 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smco2Q9DA21 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms