Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Usp12Q9D9M2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Usp12Q9D9M2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp12Q9D9M2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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Usp12Q9D9M2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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