Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms