Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D9D9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D9D9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D9D9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D9D9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D9D9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D9D9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D9D9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D9D9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D9D9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D9D9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D9D9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D9D9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D9D9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D9D9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D9D9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D9D9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D9D9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9D9D9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9D9D9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9D9D9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9D9D9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9D9D9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9D9D9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9D9D9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9D9D9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D9D9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D9D9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D9D9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D9D9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D9D9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D9D9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D9D9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D9D9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D9D9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D9D9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms