Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tvp23bQ9D8T4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms