Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9D8Q6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9D8Q6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9D8Q6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9D8Q6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9D8Q6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9D8Q6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9D8Q6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9D8Q6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9D8Q6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9D8Q6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9D8Q6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9D8Q6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9D8Q6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q9D8Q6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q9D8Q6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q9D8Q6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q9D8Q6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms