Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl4Q9D8E6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms