Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
U2af1Q9D883 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms