Protein–RNA interactions for Protein: Q9D848

AY761184, CRS1C-3, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY761184Q9D848 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AY761184Q9D848 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AY761184Q9D848 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AY761184Q9D848 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AY761184Q9D848 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AY761184Q9D848 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AY761184Q9D848 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AY761184Q9D848 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AY761184Q9D848 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AY761184Q9D848 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AY761184Q9D848 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AY761184Q9D848 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AY761184Q9D848 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AY761184Q9D848 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AY761184Q9D848 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AY761184Q9D848 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AY761184Q9D848 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AY761184Q9D848 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AY761184Q9D848 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AY761184Q9D848 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AY761184Q9D848 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AY761184Q9D848 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AY761184Q9D848 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AY761184Q9D848 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AY761184Q9D848 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AY761184Q9D848 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms