Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
2310002L09RikQ9D7L5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
2310002L09RikQ9D7L5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
2310002L09RikQ9D7L5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
2310002L09RikQ9D7L5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
2310002L09RikQ9D7L5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
2310002L09RikQ9D7L5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
2310002L09RikQ9D7L5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
2310002L09RikQ9D7L5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
2310002L09RikQ9D7L5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
2310002L09RikQ9D7L5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
2310002L09RikQ9D7L5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
2310002L09RikQ9D7L5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
2310002L09RikQ9D7L5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
2310002L09RikQ9D7L5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
2310002L09RikQ9D7L5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
2310002L09RikQ9D7L5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
2310002L09RikQ9D7L5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
2310002L09RikQ9D7L5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
2310002L09RikQ9D7L5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
2310002L09RikQ9D7L5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
2310002L09RikQ9D7L5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
2310002L09RikQ9D7L5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
2310002L09RikQ9D7L5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
2310002L09RikQ9D7L5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
2310002L09RikQ9D7L5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
2310002L09RikQ9D7L5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
2310002L09RikQ9D7L5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
2310002L09RikQ9D7L5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
2310002L09RikQ9D7L5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
2310002L09RikQ9D7L5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
2310002L09RikQ9D7L5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms