Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms