Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab11fip1Q9D620 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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