Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
4930449I24RikQ9D5E3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms