Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms