Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D4W2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D4W2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D4W2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D4W2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D4W2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D4W2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D4W2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms