Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gcc1Q9D4H2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms