Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W5

Lrrc71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc71Q9D3W5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc71Q9D3W5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc71Q9D3W5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms